Lexikon
a mikroorganizmusok definíció szerint olyan apró élőlények, melyek csak mikroszkóppal láthatóak. Ebből következik a mikroorganizmus lehet baktérium, élesztőgomba, fonalas gomba, egysejtű vagy fonalas növény alga, protozoa állati egyejtűek, vagy korlátozott számú sejtből álló kisebb élőlények. A talaj és az üledék tipikus élőhelye a mikroorganizmusoknak, a mikroorganizmus-közösségeknek, ahol a holt szerves anyagok és a hulladékok hasznosítása, mineralizációja folyik. A holt szerves anyagokra és hulladékokra specializálódott táplálékláncok mikroorganizmusok sokaságát jelenti, meléyek nem egyszerű lineáris táplálékláncot, hanem dinamikusan változó közösségként sokkal inkább hálózatot alkotnak. Ebben a hálózatban a legkülönfélébb viszonyokban élnek együtt az élőlények és teljesítik feladatukat a biogeokémiai ciklusban, a talaj kialakításában, a holt szerves anyagok hasznosításában és a hulladékok és szennyezőanyagok eltüntetésében. A legfontosabb mikrobiális együttélések és együttműködések a talajban a szimbiózis együttélés, egymásrautalt viszonyban, antibiózis egymás gátlása, kompetíció versengés, parazitizmus az egyik élőplény kihasználja a másikat, anélkül, hogy viszonozná, predáció a predátor elfogyasztja a prédát, antagonizmus egy mást gátló jelenlét, szinergizmus egymást segítő, erősítő jelenlét, kommenzalizmus közös táplálkozás, melyben a domináns táplálkozó maradékát fogyasztja a másik, anélkül, hogy rontaná annak esélyeit amenzalizmus egymás elől fogyasztják el a táplálékot, protokooperáció kezdetleges együttműködés, kooperáció egymást segítő együttműködés, konzorciális együttműködés több faj egymást segítő együttműködése.